目的：

DNA甲基化谱分析以前在许多肿瘤类型中均未发现具有生物学和临床意义的亚组，但尚未在血管肉瘤中进行。血管肉瘤是一种罕见的肉瘤，临床表现非常不同，可能是由于生物学背景的差异。在这项探索性研究中，对来自内脏，深部软组织，辐射诱导和紫外线诱导定位的36例原发性血管肉瘤样品进行了DNA甲基化分析。

实验设计：

从全国范围内的荷兰血管肉瘤搜寻中收集内脏，软组织，辐射诱发和紫外线诱发来源的原发性血管肉瘤福尔马林固定石蜡包埋的样本。提取DNA，用Illumina Infinium MethylationEPIC阵列进行甲基化分析。进行了质量控制评估和无监督的层次聚类。产生拷贝数概况并分析染色体稳定性。临床数据来自荷兰癌症登记处。

结果：

通过对36个血管肉瘤样品（6个内脏，5个软组织，14个辐射诱导，11UV诱导）的无监督分层聚类进行DNA甲基化分析，发现了两个主要簇（A和B），分为四个子簇。这些聚类在很大程度上与临床亚型相对应，显示在聚类A1中由紫外线引起的病例和在聚类A2中由辐射引起的病例都丰富。内脏和软组织病例几乎完全落入B组。与B组相比，A组显示出明显的染色体不稳定性和更好的总体存活率（22vs.6个月，P=0.046）。

结论：

在这项新颖的甲基化分析研究中，我们首次证明了四个不同的血管肉瘤簇。这些簇与临床亚型，总体存活率和染色体稳定性相关。