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水貂届已经爆发变异的COVID-19

来源:nature2020-11-16

nature 2020-11-16

丹麦卫生官员已经发布了有关在养殖的水貂和人中传播的SARS-CoV-2突变簇的遗传和实验数据,几天后,他们宣布该突变可能危害潜在的COVID-19疫苗的有效性。

突变的消息促使丹麦首相梅特·弗雷德里克森(Mette Frederiksen)于114日宣布了在可预见的未来终止水貂养殖的计划-淘汰了约1,700万只动物-引发了关于这种行动是否合法的激烈辩论。但是科学家们小心谨慎,直到看到数据才发出警报。

现在,审查数据的科学家表示,突变本身并不特别在意,因为几乎没有证据表明它们可以使病毒更容易在人体内传播,更致命,或者会危害治疗剂和疫苗。我们知道的与水貂相关的突变与快速传播,发病率和死亡率无任何变化,英国牛津大学的病毒学家Astrid Iversen说。

但是研究人员说,鉴于这种病毒在貂皮中的迅速而不受控制的传播(自六月以来已在200多个农场中发现),可能有必要对动物进行扑杀,这使这些动物成为了可以轻易感染人类的巨大病毒源。艾弗森说,在水貂养殖场受到影响的地区,患有COVID-19的人数大量增加。貂皮的数量大约是丹麦人的三倍。她说:貂皮是必要的。

丹麦卫生部门负责人史坦顿·血清研究所的病毒学家扬尼克·福纳格(Jannik Fonager)说,不受控制的貂皮传播也增加了这种病毒进化和发展可能引起关注的突变的机会。他说,科学家与政府分享了他们的担忧,但政府决定剔除水貂。

1110日,政府提交了立法,以允许剔除,并敦促农民开始这一过程。

水貂突变

福纳格说,丹麦的研究人员已经对40个水貂场的病毒样本进行了测序,并鉴定出170种冠状病毒变种。他补充说,在人的病毒样本中(约占该国已确诊的COVID病例总数的五分之一),他们在人体内发现了约300种可以追溯到貂皮的变体,这意味着它们包含的变异被认为是首先在貂皮中出现的。 这是我们真正想要密切关注的事情。

在貂和人的病毒样本中,研究人员发现了编码冠状病毒刺突蛋白的基因中的几个突变,该突变蛋白可用于进入细胞。这引起研究人员的关注,因为该区域的变化可能会影响免疫系统检测感染的能力。许多疫苗还训练免疫系统来阻断刺突蛋白。

特别令人关注的是一种病毒变体,其中包含独特的突变组合,称为“ Cluster-5”,在该国北部日德兰半岛地区的5个农场和12个人中发现了这种变体。Fonager说,Cluster-5变异体会导致刺突蛋白发生三个氨基酸变化和两个缺失。

初步的细胞实验表明,一些从COVID-19中恢复的人的抗体比不携带Cluster-5突变的病毒更难以识别Cluster-5变体。丹麦首席兽医官给世界动物卫生组织的一封信显示,这表明该变体对抗体治疗或疫苗的反应可能较弱,并告知政府决定剔除养殖的水貂。丹麦粮食和渔业部长莫根·延森(Mogens Jensen)在一份公开声明中说:在这种疫苗处于危险之中的情况下,这是正确的做法,而目前这种疫苗正处于非常黑暗的隧道尽头。” 115日。

但是审查了现有数据的研究人员说,这些说法是推测性的。艾弗森说,Cluster-5变种似乎在人们中是死胡同,因为它尚未广泛传播。许多被感染的人在农场工作,并可能接触了高剂量的病毒。她说,尽管有广泛的测序和数据共享,但自9月以来仍未见到该变体。

艾弗森补充说,实验工作太局限了,无法得出有关其对疗法和疫苗的影响的任何结论。在这种情况下,不要过度解释非常初步的数据真的很重要。

传播人

一种与水貂有关的突变已在人们中广泛传播。Y453F突变还编码了刺突蛋白中的氨基酸变化,并且已在丹麦人的约300个序列以及荷兰貂和人的序列中发现。实验研究表明,具有Y453F突变的病毒变体无法通过商业单克隆抗体检测到。

艾弗森说,但这并不意味着这种突变会阻碍该药物在体内的治疗作用。

英国格拉斯哥大学的病毒学家戴维·罗伯森说,目前尚不清楚人类中所有与水貂有关的突变是否真的起源于水貂,因为并非所有数据都已被释放。

马萨诸塞州总医院,波士顿麻省理工学院和哈佛大学广泛的计算生物学家卡斯珀·拉格(Kasper Lage)说,但是有一些突变源于貂皮并传给人类。许多研究人员担心,病毒通过数百万只貂的失控传播最终可能导致有问题的突变。

疫情不受控制

在丹麦,世界上最大的貂皮生产国,尽管采取了广泛的控制措施,但当局仍在努力控制农场暴发。在许多受影响的农场中,几乎所有动物都具有针对病毒的抗体。在荷兰,瑞典,西班牙,意大利和美国的貂场也发现了暴发。荷兰计划到2021年淘汰全部水貂种群,并加快计划到2024年终止水貂养殖。

哥本哈根大学的流行病学家兼兽医Anette Boklund说,科学家仍然不知道该病毒如何进入农场。她的团队发现家蝇以及貂笼附近的头发和空气样本中的病毒RNA含量较低。

他们还测试了该地区的野生生物,包括狐狸,badge,猫和石貂。唯一的阳性野生生物样本来自海鸥脚。博克伦德说,受感染的农场工人是最有可能的来源。

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