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MetaMed :将微生物群功能与药物治疗联系起来

来源:ASM2019-11-04

ASM 2019-11-04

在这里,我们介绍MetaMed,这是一种新颖的,集成的全系统相关性映射系统,可将细菌功能与药物疗法联系起来,为深入研究微生物疗法对人类健康的影响提供了新的假设。此外,还发现了生活在环境中的微生物与药物之间的全面关系,为发现具有巨大生物应用潜力的微生物群代谢产物提供了丰富的资源。

人类微生物群在治疗结果中的重要性已广为人知。解密微生物对人类健康的影响已成为临床研究中的一个具有挑战性的问题。微生物通过各种途径影响人体,例如通过代谢产物的产生和生物活性成分的释放来调节宿主的新陈代谢和免疫力,从而影响健康状况以及疾病的发生和/或发展。尽管这种微生物群与宿主相互作用的确切机制是复杂的,并且在很大程度上仍未得到充分探索,但通过利用现有药物的可用注释信息将微生物代谢物与现有药物或小分子联系起来,将提供有用的指导和新颖的假说来解密微生物对人类健康的影响。

为此,我们引入了MetaMedMeta基因组学医学映射系统),这是一种新颖的,系统性的,全系统的关联映射系统,用于将细菌功能与药物治疗联系起来。在该系统中,微生物代谢物实体与药物实体之间的明确定义的相似性评分适用于将微生物功能与现有药物疗法联系起来。我们提供了全面而可靠的证据,表明这种简单的链接策略可以帮助准确预测微生物对人体的影响。此外,这样的预测还有助于推导出假说,这些假说将有助于发现具有重大药物应用潜力的微生物群代谢产物。

 

doi10.1128/mSystems.00413-19

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